青年校友会由全球总会和地方分会构成，下设有会员代表大会、理事会、监事会、秘书处四层机构实现高效治理，其组织体系兼具规范性与灵活性，具体体现为：

组织类型：由“全球总会”统筹全局，联动四川、北京、湖南、安徽、大连等“地方分会”，形成覆盖广泛、层级联动的协作体系。

组织结构：依托“会员代表大会、理事会、监事会、秘书处”四层机构，明确权责分工，确保决策、监督与执行的高效运转。

虚拟小组：鼓励各地分会以兴趣为导向，灵活组建书画、羽毛球、篮球等“虚拟活动小组”，进一步丰富校友互动形式，增强凝聚力。

理事会作为青年校友会的决策核心，由会长全面领导，副会长协助统筹，常务理事与理事共同参与重大事项的审议与决策。理事会定期召开会议，制定组织发展战略，审批年度工作计划与预算，并协调全球总会与各地方分会的重要事务；监事会是青年校友会的监督机构，由监事长主持工作，副监事长协助监督，监事负责具体监察事务。监事会独立行使监督权，重点审查财务收支状况、项目执行合规性以及理事会决策程序的规范性；秘书处作为校友会的执行机构，在秘书长领导下开展日常工作，副秘书长分管不同业务板块，助理秘书长协助处理专项事务，秘书处还设有宣传部、会员部和内务部。秘书处团队以专业化服务支撑校友会的日常运转，是连接总会与分会、落实各项决策的关键纽带。